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加速生命科學(xué)大模型落地,騰訊構(gòu)建了一個新的AI生態(tài)
發(fā)布時間:2025-09-23 12:42:26 文章來源:實(shí)況網(wǎng)
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眾多投身生命科學(xué)的互聯(lián)網(wǎng)公司中,騰訊或是最先破局的那一個。

2025年的騰訊全球數(shù)字生態(tài)大會中,騰訊健康總裁吳文達(dá)對騰訊的生命科學(xué)解決方案進(jìn)行了一次全方位的拆解。

整體架構(gòu)方面,騰訊生命科學(xué)實(shí)驗(yàn)室通過多尺度、多模態(tài)技術(shù)串聯(lián),共同構(gòu)建了從分子到細(xì)胞、組織再到系統(tǒng)的全棧研究體系,以“數(shù)據(jù)-算法-平臺”為主軸,形成覆蓋基礎(chǔ)研究、技術(shù)工具、應(yīng)用落地的完整生態(tài)。

基礎(chǔ)能力方面,騰訊健康聚焦其存儲、算力、AI開發(fā)與應(yīng)用,為生命科學(xué)行業(yè)提供“數(shù)智化解決方案”,并通過組學(xué)平臺 “AI模型倉庫”,整合來自騰訊生命科學(xué)實(shí)驗(yàn)室的頂刊AI模型,以及開源和用戶私有大模型,降低單細(xì)胞、基因組、蛋白質(zhì)組等全鏈條研究的技術(shù)門檻。

成果輸出方面。“云深智藥”平臺可加速藥物發(fā)現(xiàn)和優(yōu)化,利用AI預(yù)測蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu),生成新的小分子或抗體分子,全面加速藥物的篩選和優(yōu)化。

完整鏈路之下,這套體系現(xiàn)已鏈接起數(shù)千個制藥人員,協(xié)作多家藥企提速藥物設(shè)計。當(dāng)AI成為藥企數(shù)字化變革中的必答題,騰訊或許面臨一個新的千億級機(jī)遇。

01

在單細(xì)胞測序中率先引入大模型

早在2022年,騰訊生命科學(xué)實(shí)驗(yàn)室便率先在單細(xì)胞測序領(lǐng)域構(gòu)建大語言模型scBeat。該模型基于BERT范式,可將細(xì)胞中基因的表達(dá)信息轉(zhuǎn)化成可被計算機(jī)理解、學(xué)習(xí)的“語言”,并對細(xì)胞進(jìn)行精準(zhǔn)標(biāo)注,分析出基因之間的復(fù)雜關(guān)系。

相關(guān)研究最終被國際頂級學(xué)術(shù)期刊《Nature Machine Intelligence》收錄。據(jù)騰訊生命科學(xué)實(shí)驗(yàn)室首席科學(xué)家姚建華介紹:該模型在預(yù)訓(xùn)練階段通過大規(guī)模無標(biāo)注訓(xùn)練數(shù)據(jù)學(xué)習(xí)通用的基因和表達(dá)編碼,可有效提升模型的魯棒性與泛化能力。此外,基于少量數(shù)據(jù)微調(diào),騰訊生命科學(xué)實(shí)驗(yàn)室有效提升模型的準(zhǔn)確性。

進(jìn)入空間蛋白組學(xué)時代后,騰訊生命科學(xué)實(shí)驗(yàn)室同樣迅速在此領(lǐng)域推出AI工具。

細(xì)胞類型注釋是“蛋白空間表達(dá)信息”與“生物學(xué)功能解讀” 的核心橋梁。在進(jìn)行空間蛋白組學(xué)研究前,研究者必須先全面注釋空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的細(xì)胞類型,保障蛋白質(zhì)表達(dá)數(shù)據(jù)與具體細(xì)胞功能、組織微環(huán)境作用或疾病機(jī)制關(guān)聯(lián)。但傳統(tǒng)工具能力有限,研究人員需要能有效降維且對數(shù)據(jù)噪聲具有穩(wěn)健性的高性能注釋方法,Spatial-ID 應(yīng)運(yùn)而生。

“為了解決上述問題, 我們首先采用遷移學(xué)習(xí)的方法,把單細(xì)胞的模型遷移到空間組學(xué)上,再利用AI中編碼器的方法來編碼它的基因和空間的信息。最后,我們構(gòu)建了Spatial-ID這個模型分析新的空間組學(xué)數(shù)據(jù)。”姚建華在演講中談到。

據(jù)相關(guān)實(shí)驗(yàn)統(tǒng)計,Spatial-ID的細(xì)胞類型注釋速度較傳統(tǒng)方法高出百倍,準(zhǔn)確度提升20%,還同期解決了數(shù)據(jù)缺失和批次效應(yīng)的問題。

在四個不同的空間轉(zhuǎn)錄組公開數(shù)據(jù)集上開展的基準(zhǔn)測試中,Spatial-ID 與現(xiàn)有8種先進(jìn)方法(Seurat、SingleR 等)進(jìn)行性能對比,最終在各數(shù)據(jù)集的分析上均取得了顯著優(yōu)于其他方法的準(zhǔn)確性。

例如在小鼠初級運(yùn)動皮層數(shù)據(jù)集上,Spatial-ID達(dá)到了92.75%的平均準(zhǔn)確率;在小鼠下丘腦視前區(qū)的三維空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)集上,其細(xì)胞類型注釋平均準(zhǔn)確性比最佳的SOTA方法提升了約 6.5%。

為了進(jìn)一步推動空間蛋白組學(xué)的發(fā)展,姚建華等研究員還收集和整理了業(yè)界規(guī)模最大的空間組學(xué)數(shù)據(jù)集SODB(Spatial Omics DataBase),現(xiàn)已收錄了約5億個細(xì)胞,總數(shù)據(jù)量超過1T,同時提供完整的數(shù)據(jù)分析和可視化的流程。

總的來說,騰訊在生命科學(xué)領(lǐng)域的持續(xù)突破,不僅推動基礎(chǔ)科研效率與精度革新,也為解析生命機(jī)制、探索疾病奧秘提供關(guān)鍵工具,已在一定程度上帶動相關(guān)行業(yè)向前躍進(jìn)。

02

平臺化思維重構(gòu)AI新藥研發(fā)

相較于生命科學(xué),騰訊在AI新藥研發(fā)方向入局更早,相關(guān)落地成果也更為多元。

騰訊AI制藥技術(shù)負(fù)責(zé)人劉偉在會上講述了騰訊開發(fā)制藥大模型的邏輯,他認(rèn)為:“藥物研發(fā)涉及小分子、抗體、ADC、核苷酸藥物及疫苗等多模態(tài)需求,因而需要聚焦原子層級,構(gòu)建底層統(tǒng)一大模型。通過深入研究原子作用力與原子凝聚體結(jié)構(gòu),騰訊健康讓模型可適配上層各類藥物研發(fā)場景,為不同模態(tài)藥物研發(fā)提供基礎(chǔ)支撐。”

在結(jié)構(gòu)預(yù)測方面,騰訊的原子級大模型已初露鋒芒。以抗體人源化改造為例,傳統(tǒng)模型依賴序列及上層數(shù)據(jù)訓(xùn)練,難以捕捉微小變化帶來的影響,而騰訊的大模型能感知原子變化引發(fā)的結(jié)構(gòu)、作用力及分子間相互作用的改變等,提升合成抗體成功率,并保證其具備高結(jié)合親和力。

進(jìn)一步談DNA和蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測。AlphaFold3等主流工具雖能預(yù)測 DNA 雙螺旋結(jié)構(gòu),但在溝槽結(jié)構(gòu)、卷曲角度等關(guān)鍵參數(shù)上與真實(shí)結(jié)果差異較大,無法滿足高要求應(yīng)用場景。面對這一缺陷,騰訊結(jié)合原子層面大模型與分子動力學(xué)模擬等計算方法,大幅提升了從序列或結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)構(gòu)的效果,該成果已應(yīng)用于核酸藥物研發(fā),并可擴(kuò)展到 RNA 相關(guān)領(lǐng)域。

在大模型應(yīng)用實(shí)踐中,騰訊已經(jīng)通過多個案例驗(yàn)證了其AI能力。

在AI 預(yù)測抗體藥物篩選方向上,傳統(tǒng)方法通過免疫動物、提取抗體后進(jìn)行生物膜干涉實(shí)驗(yàn)篩選,成本高昂。相較之下,騰訊從抗體序列建模入手,利用AI預(yù)測抗體與抗原的結(jié)合能力及親和力,第二輪篩選通過聚類相似序列進(jìn)一步減少實(shí)驗(yàn)環(huán)節(jié),最終正確率會比傳統(tǒng)的ELISA提升3-5倍,研發(fā)成本降低超過40%。

此外,騰訊還自研了大語言模型驅(qū)動的抗生素耐藥性數(shù)據(jù)庫MdrDB。該數(shù)據(jù)庫不僅收錄的菌類分布、全球主要致死耐藥性細(xì)菌致因數(shù)據(jù)與世界衛(wèi)生組織公布結(jié)果高度一致,還具備耐藥機(jī)制解析、突變模式揭示等能力,能夠助力新靶點(diǎn)的發(fā)現(xiàn)與抗菌藥物的研發(fā),可為流感、新冠等疾病的未來演化預(yù)判及藥物研發(fā)提前規(guī)劃提供有力支持。

03

趕上創(chuàng)新藥爆發(fā)的風(fēng)口

回顧生命科學(xué)與制藥領(lǐng)域中的布局之外,騰訊似乎在這兩個前沿領(lǐng)域找到了它熟悉的B端打法——聚焦于搭建平臺化的覆蓋臨床前新藥研發(fā)全流程的AI工具,進(jìn)而構(gòu)建其獨(dú)有的創(chuàng)新藥生態(tài)體系。

相較于躬身入局,這一邏輯顯然能夠更好地發(fā)揮體系之中個角色的比較優(yōu)勢,以低于行業(yè)的平均研發(fā)成本搶奪行業(yè)先機(jī)。

2024年,中國創(chuàng)新藥企業(yè)憑借爆發(fā)式出海迅速完成投資變現(xiàn),全年創(chuàng)新藥交易總金額高達(dá)3630.98億元,并在2025年延續(xù)著增長的趨勢。

風(fēng)口之下,騰訊的這套布局或?qū)⒙氏戎鋵?shí)現(xiàn)AI在生物制藥的工業(yè)轉(zhuǎn)化,甚至有望形成一個全新的收入增長極。

 

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