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焦點資訊:諾獎得主團隊開發(fā)高精度基因表達調控系統(tǒng),脫靶率比CRISPR/Cas13系統(tǒng)降低10倍
發(fā)布時間:2022-07-05 08:15:05 文章來源:藥明康德官微
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(資料圖)

由于現(xiàn)有技術的效率和精確度欠佳,對哺乳動物細胞的基因轉錄本進行穩(wěn)定、精確的靶向敲低(knock-down)在現(xiàn)階段仍是一個具有挑戰(zhàn)性的難題。近日,諾貝爾獎得主Jennifer Doudna教授所領導的研究團隊成功開發(fā)了基于CRISPR-Csm復合物的新型基因表達調控系統(tǒng),該系統(tǒng)在維持最低水平的脫靶效應(off-target effects)的同時,在哺乳動物細胞中對RNA敲低的效率可達到90%-99%,遠高于現(xiàn)有的其他技術(如shRNA,Cas13相關技術),極大地提高了靶向RNA的敲低效率。這一研究成果已整理發(fā)表在預印本平臺bioRxiv(題:Precise Transcript Targeting by CRISPR-Csm Complexes)。

CRISPR-Csm是一種來源于來自原核生物的III型CRISPR系統(tǒng)的多蛋白復合物,可對細胞核以及細胞質中的RNA轉錄本進行精確的敲除。作為CRISPR系統(tǒng)適應性免疫機制的一部分,CRISPR-Csm運用可編碼的RNA引導機制來尋找和降解目標RNA分子,并且不會誘發(fā)對細胞RNA的無區(qū)別切割,這一特點可能使其比CRISPR-Cas13家族酶更具優(yōu)勢。

研究人員補充道:“盡管多亞基Cas蛋白在自然界中普遍存在,但由于其組成結構的復雜性,它們很少被用作真核生物的基因工具(除了少數(shù)例外)”,而這也是促使他們將研究關注點轉向Csm的原因。

在該預印本文章中,作者表示:“與現(xiàn)有的技術方法相比,Csm是一種頗為有效的RNA敲低工具。一個僅在原核生物中被發(fā)現(xiàn)的獨立系統(tǒng)卻可以被引入真核生物中,而不會與RNAi等宿主自身的RNA調節(jié)途徑發(fā)生交集。此外,不同于RNAi,它可以定位于細胞核并用于靶向核內非編碼RNA以及mRNA前體分子。與Cas13相比,Csm僅在crRNA(CRISPR RNA)的靶點互補區(qū)域內進行順式切割,因此不會出現(xiàn)反式切割的現(xiàn)象。此外,與Cas13不同的是,Csm介導的RNA切割不會優(yōu)先發(fā)生在特定的核苷酸堿基上,也不會直接受到側翼序列的影響”。

簡言之,該研究開發(fā)了在真核生物中靶向敲低RNA的新工具,即在不對DNA進行永久性改變的情況下改變細胞和生物體內RNA和蛋白質水平的能力。在產(chǎn)業(yè)中,這種類型的RNA敲低已經(jīng)可以通過RNAi藥物完成,但這一技術可能面臨脫靶效應(切割目標位點之外的位點)、以及與缺乏RNA干擾(RNAi)機制的生物體不兼容等問題。

Doudna博士因其在基因編輯方面的工作成就與Emmanuelle Charpentier教授共同獲得了2020年諾貝爾化學獎,同時她也積極投身于生物技術產(chǎn)業(yè),作為聯(lián)合創(chuàng)始人創(chuàng)立了多家生物技術公司。

[1]David Colognori, Marena Trinidad, Jennifer A Doudna., Precise Transcript Targeting by CRISPR-Csm Complexes, bioRxiv, doi: https://doi.org/10.1101/2022.06.20.496908

[2] Doudna research team finds CRISPR-Csm delivery potentially outperforms RNAi, Cas13, Retrived June 27, 2022, from https://endpts.com/doudna-research-team-finds-crispr-csm-delivery-potentially-outperforms-rnai-cas13/

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標簽: 真核生物 治療方案 哺乳動物細胞

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